跨區線一般是指一條服務兩個或以上行政分區（例如來往屯門區及荃灣區）的路線。此類路線主要功能是方便居民往返區外工作、消閒等，通常路程較長，收費比區內線昂貴。
兩邊總站在同一個行政分區但中途經過另一個行政分區且設有車站的，例如新巴15線[1]、九巴8號線[2]、九龍專綫小巴13線[3]及新界專綫小巴12線[4]亦屬跨區線。另外，跨區線可經路線改動後成為區內線，例如九巴65K線，由上村縮短至嘉道理農場開出，往大埔中心，由一條元朗與大埔區跨區線改為大埔區區內線。
例子
因為跨區線數量眾多，故以下每個項目，只舉出數個例子以供參考。
- 新巴：4、8P、14、23、81、720、798、N8等。
- 城巴：5B、20、41A、260、592、788、A12、E22、N8X、NA20等。
- 九巴：1A、11、33A、40X、53、68M、75X、87D、261、268C、270A、296D、N216等。
- 龍運巴士：A31、E42、NA43、R33等。
- 嶼巴：1R（該公司首條跨區線）、B2等。
- 港島專綫小巴：4C、24M、58等。
- 九龍專綫小巴：2、16、62S等。
- 新界專綫小巴：1A、481、502等。
單方向跨區線
- 九巴3M線：往彩雲方向屬黃大仙區區內線；往慈雲山（北）方向，需途經位於觀塘區的彩虹站。
- 九巴31M及235M線：往葵芳站方向屬葵青區區內線；往石籬（梨貝街）或安蔭方向，需途經位於荃灣區的昌榮路分站。
- 新巴3A線：往中環（天星碼頭）方向屬中西區區內線；往摩星嶺方向，因摩星嶺道是中西區及南區的分界線，位於摩星嶺道西行線的5個巴士分站，實際上位於南區。
- 城巴85P線：往寶馬山方向屬東區區內線；往小西灣（藍灣半島）方向，需途經位於灣仔區的協同中學分站。
- 新巴X15線：往山頂方向所有車站位於中西區，而需途經灣仔區的司徒拔道，唯回程則於灣仔區設置堅拿道西一站，使該路線來回程均取道灣仔區及中西區，但其中一個方向僅為區內線。
- 九龍專綫小巴49M及54M線[5]：往坪石方向屬觀塘區區內線；往順天方向，需途經位於黃大仙區的彩雲邨。
- 新界專綫小巴87A線：往葵芳方向屬葵青區區內線；往八號貨櫃碼頭方向，因貨櫃碼頭南路是葵青區及深水埗區的分界線，故需途經深水埗區。
