分段收費（Section Fare 或 Sectional Fare）是中長途巴士或小巴路線中，向乘坐較短路程之乘客所提供相對於全程車費較便宜之車費。分段收費目前主要分為單向分段收費及雙向分段收費兩種，當中以單向分段收費較為常見。
單向分段收費
單向分段收費是指只適用於一個方向的分段收費，以累減形式計算。以新巴720線往嘉亨灣方向為例：
- 全程收費（中環（港澳碼頭）往嘉亨灣）：模板:NWFB 720
於太古城至筲箕灣道之間各站上車之乘客，乘車只需繳付$4.1，不用繳付全程車費模板:NWFB 720。至於在筲箕灣道起上車往嘉亨灣之乘客，由於距離總站嘉亨灣之路程相對較近，故可享有更為特惠之分段車費。值得一提的是，在只實施單向分段收費的路線中，在總站或首個分段點（以上述例子為例，即太古城）前登車之乘客不論於何處下車，均一律須繳付全程車費。
另外一種單向分段收費為短程分段收費，該類分段收費實屬雙向分段收費一種。
雙向分段收費
雙向分段收費是指乘客於總站或以後各站上車，於特定分段點或以前下車可繳付較低車費，而不用付全費。以城巴6X線（中環（交易廣場）↔赤柱監獄）往赤柱方向為例：
由中環及淺水灣之間登車，前往淺水灣海灘或之前各站之乘客，只需於下車時再度拍卡，則可繳付較便宜之車費（$5.3），而不用繳付往赤柱較高昂之全程車費$8.4。由於例子中的分段收費只限使用八達通繳付車資的乘客使用，因此若乘客使用現金繳費，即使在淺水灣海灘前下車，亦需繳付全程車費，不能享用分段收費。
需要注意的是，城巴6X線往中環方向，於淺水灣海灘起上車之乘客，亦設有相同的分段收費，這時，即使是以現金繳付車費，亦能享有分段收費。不過，即使路線及路程相同，分段收費的金額亦可能有所不同。以九巴N293線為例，由旺角往九龍城的分段收費（$7.4），反方向並沒有設置，而是沿用寶達往旺角的分段收費（$11.8），其實也是雙向分段收費，只是收費不同而已。
設有雙向分段收費之路線多前往郊區，不少專綫小巴路綫亦有雙向分段收費。每間巴士公司的雙向分段收費的付款模式也很不同。
九巴
由於九巴未曾考慮將其的八達通收費系統加入雙向分段收費功能，故此九巴的雙向及或短程分段收費只限繳付現金之乘客使用。為避免車廂內上車及落車的人流互相產生混亂，故目前只有少部份行走新界區的日間路線及部份通宵路線設有雙向及或短程分段收費。
目前日間路線53、64K、64P、72A、76K、77K及B1均設有雙向及或短程分段收費。乘客上車時，只須將應繳付的車費放入錢箱，便可享用雙向及或短程分段收費。
而通宵路線N216、N241、N293也設有雙向及或短程分段收費，為免出現少收車資的情況，該等路線都是下車付費。乘客上車時，如已超過分段車站，可向車長索取分段票；然後在下車時，將分段票連同應繳付的車費放入錢箱，便可享用雙向及或短程分段收費。注意該等分段收費須以現金付費，否則以八達通付款時可能需要繳付全費。
城巴新巴
城巴及新巴的雙向分段收費早期沿用中巴的收費架構，主要在一些赤柱和山頂的市郊路線才有，須以現金支付。部分路線（如14）在上車時付款，部分路線（如南行的6、262）則在下車時才付款。及後城巴設計了相關的八達通收費程式後（據聞該程式已申請專利），開始陸續改用八達通收取雙向分段收費，乘客於上車時拍卡，將會扣除全程收費；直至於落車時再拍卡一次，拍卡時將會退回全程收費減去應付的雙向分段收費後的差額。這措施減少了乘客短付車資（付短途車資坐長途車程）的機會，因此現時幾乎所有城巴[1]的雙向分段收費都只能透過八達通繳付。
2003年，捷達集團將城巴售予周大福企業有限公司，其後新巴的全部原有雙向分段收費亦都先後由現金改為八達通，往後新巴的雙向分段收費都只能透過八達通繳付。
為方便車長管理，因此早期提供雙向分段收費的路線（主要是赤柱路線）的都使用單門巴士，但隨著八達通雙向分段收費的普及，很多使用寛頭門雙門巴士的路線亦可以使用雙向分段收費。
目前城巴路線6、6A、6X、73、77、85、99、260、698R、B3A、E21、E21A、N8X、N21、N21A及R11均設有雙向分段收費；而新巴方面，路線9、14、15、N8、N8P及796C均設有雙向分段收費。
嶼巴
和九巴一樣，嶼巴的分段收費亦只限現金使用。目前路線1和4均設有雙向分段收費。
A35（機場方向）和B2（元朗方向）採用「兩段票」收費模式，此模式在外地（如台灣）較常見，但在本港則相對罕見。乘客在總站至分段點前登車和下車，須在登車時先付一段車資（當中或再設單向分段收費）。在分段點後至總站前登車的乘客，登車時不必付車資，下車時才付該段車資。如乘坐跨段的乘客（即由分段點前坐到分段點後），上車時須先付第一段車資，落車時則須繳付第二段車資。此收費方式的好處，是巴士公司不必採用複雜的八達通雙向分段系統，便能讓使用八達通的乘客享用短程下車分段收費；然而一程車有機會要繳兩次車資的安排，對不熟悉該等路線運作的乘客來說，會引起很大混亂；部分路段下車繳費，會使乘客上落時間加長，不適合客量高的路線使用。
專綫小巴
乘客如要享用專綫小巴的雙向分段收費，須在上車時按下八達通收費器上的「分段」按鍵，選定所適合的分段收費才拍卡。
如車上的八達通收費器不設「分段」按鍵，乘客須揚聲要求司機調校八達通收費器之收費。
乘客亦可選擇使用現金支付分段收費。
制定因素
運輸署視分段收費為巴士公司向乘客提供的優惠，因此只對全程收費作出規管，分段收費則未有規管，巴士公司可以自行決定設立分段收費與否。但一般巴士公司都將跨區線分段收費定得較高，以免搶走區內線的乘客，失去區內線的存在意義，以及避免因區內的乘客上落巴士而增加該線的行車時間，不過也有些個別例子：
- 九巴95線在龍翔道，彩虹邨丹鳳樓往佐敦（渡華路）的分段收費是與九龍線看齊，作為九巴13線取消後的補償。
- 九巴91M線在香港科技大學往寶林的分段收費是$3.9，這是因為九巴298M線取消後為了維持原有的收費而設立，讓乘客在回程時抵銷。
- 城巴A12線在2002年加經石塘咀時，增設往小西灣的$8分段收費，成功吸引西區往東區的新客源，改善該線的營運狀況。2005年A21亦增設類似的分段收費，吸引西九龍填海區往彌敦道的乘客選搭。
根據九巴資料[2]，目前該公司有七成路線設有分段收費，而釐定分段收費時，主要考慮以下因素：
- 乘客的需求模式；
- 該分段收費對路線及整體財政的影響；
- 其他巴士線及交通工具的收費；
- 對車務運作的影響；及
- 就長途與短途乘客所付出的車費、候車與行車時間及舒適程度等多方面的相對成本效益。
競爭
巴士公司還可以因應競爭而將分段收費調整，當一條路線在該帶沒有競爭對手時，便會把分段收費調得很高，例如：
- 九巴264M線在凹頭一帶往天水圍的收費高達$9.1。
- 九巴98C線在九龍東收費仍達$11.5。
- 九巴98D線在九龍灣收費仍達$10.9。
- 九巴296D線在九龍灣收費仍達$10.4。
- 過海隧巴962B線在青山公路－深井段往港島的收費仍達$21.8。
- 過海隧巴960線、過海隧巴961線在西隧收費廣場往港島的收費仍達$22.8。
- 過海隧巴968線在西隧收費廣場往港島的收費仍達$25.7。
反之，當巴士路線有較多競爭對手時，便會將分段收費調得較低或維持較便宜收費，例如：
- 為了與輕鐵及港鐵巴士競爭，九巴屯門及元朗區的區外非過海路線往屯門/元朗方向，到達區內後的分段收費多數都是$3.5-$4.1（2008年6月8日加價後則調高到$3.7-$4.3）（兩鐵合併後以八達通乘坐輕鐵，1-3個站收費亦是$3.7；除506外，各港鐵巴士路線的收費亦是$3.7；2010年6月13日港鐵加價後則一同調高到$3.8）。
- 為了與城巴競爭，新巴在2003年為多條南區路線（如4、46X、91等）調低及增設分段收費，部分路線甫離開總站後便在下一站開始實施分段收費，達變相減價之效。
- 為了與專綫小巴11、102及111線競爭，九巴91M線在1997年回歸鑽石山地鐵站並繞經新蒲崗時，全程行車里數由12公里增加至14.8公里，但九巴沒有加價，令該線每公里收費只值 $0.33；2004年91M取代298M延長至寶林時，全程行車里數由14.8公里增加至16.6公里，但九巴仍沒有加價，令此線每公里收費進一步降至$0.29（後來因九巴加價而調高成現時的$0.31），以行程距離計算是將軍澳區最便宜的空調巴士路線。
路線延長
九巴路線之收費乃根據行車里數而訂立，當路線長度超過指定界限時，該路線便必需加價，但同時或會於原有總站增設單向分段收費，例如：
- 九巴86線由禾輋延長至小瀝源時，行車里數剛好超過「最高准許收費」的15公里界線，故需提高全程票價，而當該線延長至黃泥頭時，行車里數加長至18.7公里，亦剛好超過「最高准許收費」的18公里界線，故需再次提高全程票價（現時全程收費$9.8，相等於馬鞍山往來九龍對外線的收費標準），為減少對乘客不便，在延長路線同時於原有總站增設往市區的單向分段收費，但由九龍返回沙田的乘客卻要多付車資。因此該線在眾多沙田區往九龍的對外線當中，比起其他一般路線為高，但分段收費又很特別，於禾輋邨往九龍空調分段是$5.7，比一般沙田區往九龍的對外線又低。
- 由恆生商學書院往九龍的單向分段收費，只是於總站開出後第三站，已有分段收費。
- 在延長路線後，該線在個別路段（例如：美孚→龍翔道），並沒有競爭對手。
- 不過該兩次延長路線都是有取巧成份的，自2002年8月18日，該線來回程改經龍翔道而不再途經歌和老街後，全程行車里數減少至18.4公里；另外，在最近美孚總站的長沙灣甘泉街總站，距離都超過五百米。
亦有些分段收費設立較高，甚至不加設，或者在較接近終點站之分站才設立，例如：
- 新巴2X線往筲箕灣方向跟隨2，由筲箕灣道開始實施$3.6分段收費，但在鯉景灣及西灣河站仍然收取$4.4，比起路線相近的巴士線為貴；
- 新巴18線及新巴18P線往北角方向於銅鑼灣避風塘仍收取全費（模板:NWFB 18），比起路線相近的巴士線如城巴99線為貴；
- 九巴13D線往維港灣方向在九龍城仍是全程收費（$7.5），比收取分段收費的九巴16線（$5.2（空調）／$4.6（非空調））為貴；
- 九巴15線往紅磡碼頭方向在寶其利街才設立$4.8之分段收費，九巴85C線，九巴85S線，九巴85X線更在總站前一個站的黃埔新邨才設立$4.4之分段收費。
營造「特快」形象
另一原因是即使有其他路線選擇，但其路線取道較直接的路段，營造「特快」形象，例如：
- 九巴15線往紅磡方向在九龍城仍是全程收費（$7.5），雖然有較便宜的3B、21等線，但這些路線是沿木廠街往土瓜灣，本線取道的浙江街便顯得直接。
- 九巴98C線往美孚方向在寶達及秀茂坪仍是全程收費（$11.5），雖然前往旺角，有較便宜的13D、93K、95，但這些路線車程都較長，本線便顯得直接。
- 城巴99線往筲箕灣方向在黃竹坑為全程收費（$9.0），雖然前往筲箕灣，有便宜的77（於香港仔漁暉道開始為$6.2），但77途經人流較多的銅鑼灣軒尼詩道及怡和街，本線途經的堅拿道天橋至維園道便顯得直接。
也有短途線的收費比起較長途的路線為貴，例如：
- 新巴27線由北角往來寶馬山的全程收費為模板:NWFB 27，新巴81A線（$4.1）及城巴529線（$4.0/3.7）往來筲箕灣及寶馬山雖然路程較長，但也比它為便宜（前者回程之分段收費更可直達柴灣）。
- 由清水灣道往順利；九巴27線收費$5.4，但九巴42線則為$3.2／$3.7。
其他分段收費特色
- 大部份過海隧道路線，過了過海隧道後的分段收費都是劃一$5.7（除了部份較長途的過海隧道路線及通宵過海路線外）。
- 過海隧巴101線在過海後往觀塘的收費$5.7，比不少九巴由紅磡至觀塘的巴士線便宜，因此亦有不少由紅磡前往東九龍區的乘客選搭，是過海隧巴少有的現象。
- 過海隧巴968線由九龍往元朗方向只收取$16.0，城巴的969組別往天水圍方向低至$14.6，比港鐵從九龍站/柯土甸站往元朗站（$16.2）和268B（$20.1）便宜，更能服務西九文化區，所以情況亦像上段過海隧巴101線一樣。西隧線往屯門區方向更低至$13.4。
- 在九巴12線延長至海麗邨前，渡船街和旺角西居民要到海麗邨，就必須乘搭過海隧巴914線。
- 過海隧巴948線及九巴獨營之西隧過海線於西隧收費廣場往港島仍然收取全費（如960仍收$22.8），明顯比城巴/新巴獨營/除948外與九巴聯營路線$9.3之分段收費為貴，甚至比城巴機場快線之分段收費（$19.0）為貴（如968仍收取$25.7）。
- 所有東隧過海線往港島均不設$9.3之分段收費，與其他兩條海底隧道的巴士線不同。
- 城巴E11線成為西隧往港島最便宜的選擇，城巴N11線亦成為深宵時九龍往港島最便宜的選擇。
- 大部份九巴來往新界及市區的路線，往市區方向到達市區後的分段收費都是$4.4／$5.3（由新界西／荃灣／葵青往西九龍）或$5.5（由新界東往九龍或新界往東九龍）(例：270A)。
- 九巴來往新界北區的區外路線往北區方向，到達北區後的分段收費多數都是$4.1（例：70X）。
- 九巴296D線往尚德方向時是設有過將軍澳隧道後往尚德的單向分段收費，不過離開將軍澳隧道後已經是唐明街，再一站就是尚德總站，兩站的距離即使步行也只需一至兩分鐘，設立該分段的原因，是作為「臨時」用途，一旦98D不能服務某些地區，而需要296D臨時更改總站時，該分段就有用。
機制漏洞
目前，巴士車廂內的銀碼顯示器及八達通收費器是由人手控制的，巴士車長忘記調校銀碼顯示器的價錢顯示及八達通收費器設定的事件時有發生，導致乘客不能享用應有分段收費。當有乘客發現此情況告知車長時，很多時候車長為避免惹上麻煩 （如：遭有關乘客向公司投訴），都會私下向有關乘客作出賠償了事。
因此，九巴的報站機每逢顯示進入分段車站時，均會播放有關分段收費的廣播，提醒車長調校銀碼顯示器的價錢顯示及八達通收費器的設定。
另外在上車時以現金收取雙向分段收費的路線，車長很多時候都難以記著個別乘客所付車資，因此很容易出現乘客付短途車資坐長途車程，導致少收車資的情況。